Contexte & Objectifs du réseau

Les racines : un levier clé pour une agriculture durable

Les racines jouent un rôle fondamental dans le fonctionnement des agro-écosystèmes. Elles influencent la séquestration du carbone, la résilience des cultures face aux stress abiotiques et biotiques, l’acquisition des ressources avec moins d’intrants et les interactions avec le microbiote du sol. Elles jouent également un rôle majeur dans le stockage du carbone dans les sols. Pourtant, plusieurs verrous scientifiques et méthodologiques freinent encore l’exploitation de ces leviers pour une agriculture plus durable.
Face à ces enjeux, le réseau Rhizophiles vise à structurer et dynamiser la recherche sur les systèmes racinaires au sein de la communauté INRAE, voire au-delà. Son ambition est de mieux caractériser les traits et fonctions racinaires, d’intégrer ces connaissances dans les programmes d’amélioration génétique et de favoriser leur transfert du laboratoire au champ. Les intégrer dans le raisonnement des pratiques et la conception des systèmes de culture de l’agriculture de demain constitue un autre impact attendu. Rhizophiles constitue ainsi une réponse collective aux défis de la transition agroécologique dans le contexte des changements globaux.

Un réseau interdisciplinaire et fédérateur

Rhizophiles rassemble des scientifiques issus de plusieurs départements INRAE (AgroEcoSystem et BAP notamment, mais aussi ECODIV, MathNum, SPE), favorisant des approches interdisciplinaires en écologie fonctionnelle, écophysiologie, génétique, écologie et biogéochimie des sols, agronomie et sciences du numérique. Il mobilise des outils innovants tels que le phénotypage haut débit et la modélisation, afin d’identifier de nouveaux traits racinaires d’intérêt et d’évaluer leur impact sur la nutrition des plantes et les cycles biogéochimiques.

Les principaux objectifs du réseau sont :

• Créer des passerelles interdisciplinaires entre équipes de recherche travaillant sur les racines, en structurant un espace d’échange autour des nouvelles approches et méthodologies.
• Identifier les défis et leviers scientifiques pour mieux comprendre le développement et le fonctionnement des systèmes racinaires et leurs rôles dans les cycles de l’eau, du carbone et des nutriments.
• Fédérer des groupes de travail sur des thématiques clés : phénotypage racinaire, relations gène-trait-fonction-service, interactions racines-environnement et synergies entre services écosystémiques...

Rhizophiles s’inscrit pleinement dans la stratégie scientifique d'INRAE, en lien avec les départements AgroEcoSystem et BAP, qui placent la recherche sur les racines au cœur des enjeux liés à la transition agroécologique et à l’adaptation au changement climatique, ainsi que son atténuation. En fédérant les expertises autour de la diversité génétique des systèmes racinaires, de leur plasticité phénotypique, ainsi que de leur impact sur la nutrition hydrominérale des plantes et le fonctionnement des sols, le réseau contribue à structurer une recherche appliquée aux défis environnementaux présents et à venir.

Rhizophiles se distingue des réseaux existants tout en étant complémentaire. Contrairement à Symbiphyt, qui aborde les symbioses sans se focaliser spécifiquement sur les racines, ou à Phenome et EPPN, centrés sur le phénotypage mais sans se restreindre aux racines, Rhizophiles se concacre exclusivement à la caractérisation des traits racinaires et à l'étude de leurs fonctions écologiques et agronomiques. De même, PlantCOM, orienté vers la génétique des interactions plante-plante, ne couvre qu'une partie de la diversité des interactions souterraines. Des synergies sont envisagées avec RhizosPHARE (créé également en 2024 et dedié à la communication entre racines et microorganismes), notamment autour des défis méthodologiques liés à la rhizodéposition et aux interactions biotiques induites par les exsudats racinaires.